介数通常分为边介数和节点介数两种。
1、节点介数定义为网络中所有最短路径中经过该节点的路径的数目占最短路径总数的比例,边介数定义为网络中所有最短路径中经过该边的路径的数目占最短路径总数的比例。
2、边介数定义为网络中所有最短路径中经过该边的路径的数目占最短路径总数的比例.。
介数反映了相应的节点或者边在整个网络中的作用和影响力,是一个重要的全局几何量,具有很强的现实意义。 例如,在社会关系网或技术网络中,介数的分布特征反映了不同人员、资源和技术在相应生产关系中的地位,这对于发现和保护关键资源、技术和人才具有重要意义。
其中的分析和可视化是用Gephi做的,Gephi是非常流行的图分析工具。但作者觉得使用Neo4j来实现更有趣。
节点中心度
节点中心度给出网络中节点的重要性的相对度量盯碰宽。有许多不同的方式来度量中心度,每种方式都代表不同类型的“重要性”。
度中心性(Degree Centrality)
度中心性是最简单度量,即为某个节点在网络中的联结数。在《权力的游戏》的图中,某个角色的度中心性是指该角色接凯亮触的其他角色数。作者使用Cypher计算度中心性:
MATCH (c:Character)-[:INTERACTS]- RETURN c.name AS character, count(*) AS degree ORDER BY degree DESC
character
degree
Tyrion
36
Jon
26
Sansa
26
Robb
25
Jaime
24
Tywin
22
Cersei
20
Arya
19
Joffrey
18
Robert
18
从上面可以发现,在《权力的游戏》网络中提利昂·兰尼斯特(Tyrion)和最多的角色有接触。鉴于他的心计,我们觉得这是有道理的。
加权度中心性(Weighted Degree Centrality)
作者存储一对角色接触的次数作为 INTERACTS 关系的 weight 属性。对该角色的 INTERACTS 关系的所有 weight 相加得到加权度中心性。作者使用Cypher计算所有角色的这个度量:
MATCH (c:Character)-[r:INTERACTS]- RETURN c.name AS character, sum(r.weight) AS weightedDegree ORDER BY weightedDegree DESC
character
weightedDegree
Tyrion
551
Jon
442
Sansa
383
Jaime
372
Bran
344
Robb
342
Samwell
282
Arya
269
Joffrey
255
Daenerys
232
介数中心性(Betweenness Centrality)
介数中心性:在网络中,一个节点的介数中心性是指其它两个节点的所有最短路径都经过这个节点,则这些所有最短路径数即为此节点的介数中心性。介数中心性是一种重要的度量,因为它可以鉴别出网络中的“信息中间人”或者网络聚类后的联结点。
图6中红色节点是具有高的介数中心性,网络聚类的联结点。吵举
为了计算介数中心性,作者使用Neo4j 3.x或者apoc库。安装apoc后能用Cypher调用其170+的程序:
MATCH (c:Character) WITH collect(c) AS charactersCALL apoc.algo.betweenness(['INTERACTS'], characters, 'BOTH') YIELD node, scoreSET node.betweenness = scoreRETURN node.name AS name, score ORDER BY score DESC
name
score
Jon
1279.7533534055322
Robert
1165.6025171231624
Tyrion
1101.3849724234349
Daenerys
874.8372110508583
Robb
706.5572832464792
Sansa
705.1985623519137
Stannis
571.5247305125714
Jaime
556.1852522889822
Arya
443.01358430043337
Tywin
364.7212195528086
紧度中心性(Closeness centrality)
紧度中心性是指到网络中所有其他角色的平均距离的倒数。在图中,具有高紧度中心性的节点在聚类社区之间被高度联结,但在社区之外不一定是高度联结的。
图7 :网络中具有高紧度中心性的节点被其它节点高度联结
MATCH (c:Character) WITH collect(c) AS charactersCALL apoc.algo.closeness(['INTERACTS'], characters, 'BOTH') YIELD node, scoreRETURN node.name AS name, score ORDER BY score DESC
name
score
Tyrion
0.004830917874396135
Sansa
0.004807692307692308
Robert
0.0047169811320754715
Robb
0.004608294930875576
Arya
0.0045871559633027525
Jaime
0.004524886877828055
Stannis
0.004524886877828055
Jon
0.004524886877828055
Tywin
0.004424778761061947
Eddard
0.004347826086956522
使用python-igraph
Neo4j与其它工具(比如,R和Python数据科学工具)完美结合。我们继续使用apoc运行 PageRank和社区发现(community detection)算法。这里接着使用python-igraph计算分析。Python-igraph移植自R的igraph图形分析库。 使用 pip install python-igraph 安装它。
从Neo4j构建一个igraph实例
为了在《权力的游戏》的数据的图分析中使用igraph,首先需要从Neo4j拉取数据,用Python建立igraph实例。作者使用 Neo4j 的Python驱动库py2neo。我们能直接传入Py2neo查询结果对象到igraph的 TupleList 构造器,创建igraph实例:
from py2neo import Graphfrom igraph import Graph as IGraph graph = Graph query = ''' MATCH (c1:Character)-[r:INTERACTS]->(c2:Character) RETURN c1.name, c2.name, r.weight AS weight '''ig = IGraph.TupleList(graph.run(query), weights=True)
现在有了igraph对象,可以运行igraph实现的各种图算法来。
PageRank
作者使用igraph运行的第一个算法是PageRank。PageRank算法源自Google的网页排名。它是一种特征向量中心性(eigenvector centrality)算法。
在igraph实例中运行PageRank算法,然后把结果写回Neo4j,在角色节点创建一个pagerank属性存储igraph计算的值:
pg = ig.pagerank pgvs = for p in zip(ig.vs, pg): print(p) pgvs.append({"name": p[0]["name"], "pg": p[1]}) pgvs write_clusters_query = ''' UNWIND {nodes} AS n MATCH (c:Character) WHERE c.name = n.name SET c.pagerank = n.pg '''graph.run(write_clusters_query, nodes=pgvs)
现在可以在Neo4j的图中查询最高PageRank值的节点:
MATCH (n:Character) RETURN n.name AS name, n.pagerank AS pagerank ORDER BY pagerank DESC LIMIT 10
name
pagerank
Tyrion
0.042884981999963316
Jon
0.03582869669163558
Robb
0.03017114665594764
Sansa
0.030009716660108578
Daenerys
0.02881425425830273
Jaime
0.028727587587471206
Tywin
0.02570016262642541
Robert
0.022292016521362864
Cersei
0.022287327589773507
Arya
0.022050209663844467
社区发现(Community detection)
图8
社区发现算法用来找出图中的社区聚类。作者使用igraph实现的随机游走算法( walktrap)来找到在社区中频繁有接触的角色社区,在社区之外角色不怎么接触。
在igraph中运行随机游走的社区发现算法,然后把社区发现的结果导入Neo4j,其中每个角色所属的社区用一个整数来表示:
clusters = IGraph.community_walktrap(ig, weights="weight").as_clustering nodes = [{"name": node["name"]} for node in ig.vs]for node in nodes: idx = ig.vs.find(name=node["name"]).index node["community"] = clusters.membership[idx] write_clusters_query = ''' UNWIND {nodes} AS n MATCH (c:Character) WHERE c.name = n.name SET c.community = toInt(n.community) '''graph.run(write_clusters_query, nodes=nodes)
我们能在Neo4j中查询有多少个社区以及每个社区的成员数:
MATCH (c:Character) WITH c.community AS cluster, collect(c.name) AS members RETURN cluster, members ORDER BY cluster ASC
cluster
members
0
[Aemon, Alliser, Craster, Eddison, Gilly, Janos, Jon, Mance, Rattleshirt, Samwell, Val, Ygritte, Grenn, Karl, Bowen, Dalla, Orell, Qhorin, Styr]
1
[Aerys, Amory, Balon, Brienne, Bronn, Cersei, Gregor, Jaime, Joffrey, Jon Arryn, Kevan, Loras, Lysa, Meryn, Myrcella, Oberyn, Podrick, Renly, Robert, Robert Arryn, Sansa, Shae, Tommen, Tyrion, Tywin, Varys, Walton, Petyr, Elia, Ilyn, Pycelle, Qyburn, Margaery, Olenna, Marillion, Ellaria, Mace, Chataya, Doran]
2
[Arya, Beric, Eddard, Gendry, Sandor, Anguy, Thoros]
3
[Brynden, Catelyn, Edmure, Hoster, Lothar, Rickard, Robb, Roose, Walder, Jeyne, Roslin, Ramsay]
4
[Bran, Hodor, Jojen, Luwin, Meera, Rickon, Nan, Theon]
5
[Belwas, Daario, Daenerys, Irri, Jorah, Missandei, Rhaegar, Viserys, Barristan, Illyrio, Drogo, Aegon, Kraznys, Rakharo, Worm]
6
[Davos, Melisandre, Shireen, Stannis, Cressen, Salladhor]
7
[Lancel]
角色“大合影”
《权力的游戏》的权力图。节点的大小正比于介数中心性,颜色表示社区(由随机游走算法获得),边的厚度正比于两节点接触的次数。现在已经计算好这些图的分析数据,让我们对其进行可视化,让数据看起来更有意义。
Neo4j自带浏览器可以对Cypher查询的结果进行很好的可视化,但如果我们想把可视化好的图嵌入到其它应用中,可以使用Javascript可视化库Vis.js。从Neo4j拉取数据,用Vis.js的neovis.js构建可视化图。Neovis.js提供简单的API配置,例如:
var config = { container_id: "viz", server_url: "localhost", labels: { "Character": "name" }, label_size: { "Character": "betweenness" }, relationships: { "INTERACTS": }, relationship_thickness: { "INTERACTS": "weight" }, cluster_labels: { "Character": "community" } }; var viz = new NeoVis(config); viz.render;
其中:
节点带有标签Character,属性name;
节点的大小正比于betweenness属性;
可视化中包括INTERACTS关系;
关系的厚度正比于weight属性;
节点的颜色是根据网络中社区community属性决定;
从本地服务器localhost拉取Neo4j的数据;
在一个id为viz的DOM元素中展示可视化。
是这样的是吗:有一个分数,分母加1等于2/桥笑埋1,分母减一等于5/3,求这个分数升冲
设这介数为x/y
则:(x+1)/y=2 即:x=2y-1 (1)
(x-1)/y=5/3 即:3x-3=5y (2)
(1)代入(2)得:3(2y-1)-3=5y
y=6
x=11
这个分敏蚂数 为:11/6
先解释4个参数。
高截止频率:fh是高截止频率。默认值为0.45。
如滤波器类型为0(lowpass)或1(highpass),VI将忽略该参数。
滤波器类型为2 (Bandpass)或3 (Bandstop)时,高截止频率: fh必须大于低截止频率:fl并且满足奈奎斯特准则。
奈奎斯特准则(Nyquist criterion): 0 f1< 0.5fs,其中f1为截止频率,fs为采样频率。
低截止频率
fl是低截止频率并且必须满足Nyquist准则。默认值为0.125。
如低截止频率:fl小于0或大于采样频率的一半,VI将把滤波后X设置为空数组并返回错误。
滤波器类型为2 (Bandpass) 或3 (Bandstop)时,低截止频率:fl必须小于高截止频率:fh。
介数
阶数指定滤波器的阶数并且必须大于0。默认值睁轿蠢为2。 如阶数小于等于0,VI将把滤波后X设置为空数组并返回错误。
采样频率
fs是采样频率并且必悉陪须大于0。默认值为1.0。 如采样频率:帆帆fs小于等于0,VI将把滤波后X设置为空数组并返回错误。
另外在说明一下。
调用Butterworth系数VI后,Butterworth滤波器VI将调用IIR级联滤波器VI,获取一个Butterworth滤波后X序列。
高截止频率:fh和低截止频率:fl必须符合下列条件:
0 < f1 < f2 < 0.5fs
其中f1为低截止频率:fl,f2为高截止频率:fh,fs为采样频率:fs。
VI的范例见labviewexamplesanalysisfltrxmpl.llb中的Extract the Sine Wave VI
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